Vy-lès-Lure a une école avec 3 classes au village (une maternelle et  CP). Une nouvelle classe a été ouverte à la rentrée 2007.

Les autres cours étant dans le regroupement pédagogique entre Vy-lès-Lure, Les Aynans et le Val de Gouhenans (102 élèves pour la rentrée 2008)